MBBR प्रक्रियाको सिद्धान्त भनेको रिएक्टरमा निश्चित मात्रामा सस्पेन्सन क्यारियर थपेर रिएक्टरमा बायोमास र प्रजातिहरू बढाउनु हो, ताकि रिएक्टरको उपचार क्षमतामा सुधार हुन्छ। किनभने फिलरको घनत्व पानीको नजिक छ, यो वातनको समयमा पानीसँग पूर्ण रूपमा मिसिन्छ, र माइक्रोबियल विकासको लागि वातावरण ग्यास, तरल र ठोस हुन्छ। पानीमा वाहकको टक्कर र कतरनी प्रभावले हावाको बुलबुलेलाई अझ राम्रो बनाउँछ र अक्सिजनको उपयोग दर बढाउँछ। थप रूपमा, प्रत्येक वाहक भित्र र बाहिर विभिन्न जैविक प्रजातिहरू छन्, केही एनारोबिक ब्याक्टेरिया वा फ्याल्टेटिभ ब्याक्टेरिया भित्र बढ्छन्, र बाहिर राम्रो ट्रोफिक ब्याक्टेरिया हो, त्यसैले प्रत्येक वाहक एक लघु रिएक्टर हो, ताकि नाइट्रिफिकेशन प्रतिक्रिया र डिनिट्रिफिकेशन प्रतिक्रिया समान रूपमा अवस्थित हुन्छ। समय, ताकि उपचार प्रभाव सुधार गर्न।